Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms