Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms