Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NrepQ07475 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NrepQ07475 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms