Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms