Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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