Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms