Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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