Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms