Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CkbQ04447 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CkbQ04447 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CkbQ04447 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CkbQ04447 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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