Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms