Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms