Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top2aQ01320 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms