Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms