Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms