Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms