Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms