Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Slc35b1P97858 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Slc35b1P97858 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Slc35b1P97858 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Slc35b1P97858 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Slc35b1P97858 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Slc35b1P97858 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms