Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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