Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms