Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Otx1P80205 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms