Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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