Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp46P62069 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp46P62069 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms