Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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