Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ctdsp1P58466 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ctdsp1P58466 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ctdsp1P58466 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ctdsp1P58466 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ctdsp1P58466 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ctdsp1P58466 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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