Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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