Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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