Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbrP50284 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms