Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpreP49446 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtpreP49446 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpreP49446 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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