Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CitP49025 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms