Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms