Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tac1P41539 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms