Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms