Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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