Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CftrP26361 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CftrP26361 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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