Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PparaP23204 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PparaP23204 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PparaP23204 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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