Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3aP23116 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms