Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Fcer1aP20489 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Fcer1aP20489 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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