Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms