Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms