Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18528 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18528 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms