Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18525 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18525 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P18525 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms