Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Hoxb1P17919 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Hoxb1P17919 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Hoxb1P17919 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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