Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms