Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms