Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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