Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01645 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01645 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms