Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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