Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ldb2O55203 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ldb2O55203 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ldb2O55203 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms