Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2O35245 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms