Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MttpO08601 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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MttpO08601 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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MttpO08601 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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MttpO08601 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MttpO08601 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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